Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtpraP18052 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtpraP18052 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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