Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcnaP17918 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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