Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms