Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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