Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P10404 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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P10404 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P10404 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P10404 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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