Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms