Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops6O88545 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cops6O88545 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms