Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms