Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Foxq1O70220 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Foxq1O70220 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Foxq1O70220 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Foxq1O70220 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Foxq1O70220 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Foxq1O70220 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms