Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms