Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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