Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NudcO35685 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NudcO35685 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NudcO35685 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NudcO35685 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms