Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Opn1mwO35599 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Opn1mwO35599 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Opn1mwO35599 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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