Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ColqO35348 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ColqO35348 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms