Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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H2-Q1O19441 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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