Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Eftud2O08810 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms