Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sema3aO08665 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms