Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MttpO08601 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms