Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms