Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms