Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3278L7N2D2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3278L7N2D2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms