Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 9130015G15Rik-201ENSMUST00000208621 1973 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm45047-201ENSMUST00000207651 309 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm45538-201ENSMUST00000210771 1061 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm21887J3QQ04 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms