Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm8888J3QPX5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm8888J3QPX5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm8888J3QPX5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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