Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20834J3QM72 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms