Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms