Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms