Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-1G3UXB3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms