Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
XntrpcF8VQM8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms