Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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