Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp32F8VPZ3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp32F8VPZ3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms