Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm28048F7BCN0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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