Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms