Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm29094F6Q785 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm29094F6Q785 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms