Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms