Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms