Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3002E9PW72 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3002E9PW72 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms