Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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