Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms