Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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