Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Phf11bB4XVQ1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Phf11bB4XVQ1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Phf11bB4XVQ1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Phf11bB4XVQ1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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