Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms