Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms