Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms