Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp42B2RQC2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp42B2RQC2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp42B2RQC2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Usp42B2RQC2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Usp42B2RQC2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp42B2RQC2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp42B2RQC2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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