Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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