Protein–RNA interactions for Protein: A3KFM7

Chd6, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd6A3KFM7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chd6A3KFM7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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