Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

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Length 2,309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col6a4A2AX52 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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