Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GabreA2AMW3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms