Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms