Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms